Generar una copia de tu información es muy fácil, sólo tenes que ir a solapa superior Herramientas > Generar copia de seguridad. Ahí podrás indicar la carpeta que quieras, por defecto es C:\NeoFactura\BK. Si queres cambiar la carpeta, podes tipearla o examinar con el botón "...".
El sistema genera un archivo ZIP con toda tu información, licencia, logo, archivos de AFIP y reportes, que luego podras restaurar en el caso de ser necesario.
Es importante que la copia no la dejes en la misma pc, podes hacerla en un pendrive en otra pc, subirla a DropBox, Google Drive, etc.
Podes integrar NeoFactura para que cada vez que hagas la copia, se suba directo a la nube de Google Drive.